孫魴出身貧寒，但從小聰明好學。唐廣明元年（880），黃巢起義軍占領長安，僖宗逃往成都，都官員外郎鄭谷避隱故鄉宜春仰山書屋。孫魴慕名前往，拜鄭谷為師。孫詩頗似鄭體，清婉明白，不過分追求華麗辭藻，民間俚語皆能入詩。遂以詩行于世。

唐景福元年（892），楊行密任淮南節度使，蘇州、揚州、金陵一帶雖經戰亂，依然是一派繁華景象。詩人沈彬、李建勛先后來到金陵，此時，孫魴參與射策考試，被楊行密命為都官從事。孫與沈、李結為詩社，經常一起飲酒唱和。吳天祚三年（937）十月，鎮守金陵的徐知誥廢吳帝，改國號為南唐，并招攬人才，不少文人逸士宿儒為他所用。孫魴被授以宗正郎。

孫魴有詩集五卷，但失傳。《全唐詩》存其詩30首，詞5首，句4條，雜曲歌詞5首。其《題金山寺》、《甘露寺》二首膾炙人口。金山寺為潤州（今江蘇鎮江）著名寺廟，歷代騷人墨客題詠甚多，但自唐代張祜吟出“僧歸夜船月，龍出曉堂云”名句后，沒人敢再題詠。直到孫魴吟出“天多剩得月，地少不生塵”佳句，時人無不叫絕，認為“騷情風韻，不減張祜”。元代辛文房編纂的《唐才子傳》列有孫魴傳介。